Το ΚΕ.ΡΕ.ΝΕ. αποτελείται από τέσσερις ερευνητικές ομάδες, οι οποίες ασχολούνται με τη μηνιαία καταγραφή των εξελίξεων στις περιοχές ενδιαφέροντος του Κέντρου, καθώς και με την εκπόνηση εργασιών με εξειδικευμένη θεματολογία.

Πρόκειται για τις εξής ομάδες :

• Ομάδα Εξωτερικής Πολιτικής, Άμυνας και Ασφάλειας

Η εν λόγω ομάδα ασχολείται με τις εξελίξεις σε επίπεδο εξωτερικής πολιτικής, την παρακολούθηση της ισορροπίας ισχύος στον μετασοβιετικό χώρο, καθώς και με τη δυναμική των σχέσεων με τις χώρες της Δύσης. Επιπλέον, αντικείμενο της ομάδας αποτελεί η εκτίμηση των παραγόντων ασφάλειας και των αμυντικών δεδομένων.

• Ομάδα Ενέργειας, Οικονομίας και Περιβάλλοντος

Η Ομάδα Ενέργειας, Οικονομίας και Περιβάλλοντος έχει ως στόχο την αποτίμηση των ενεργειακών εξελίξεων, καθώς τόσο για τη Ρωσία όσο και για την πλειονότητα των χωρών της Ευρασίας ο ενεργειακός τομέας αποτελεί το “ισχυρό” τους χαρτί.  Στον οικονομικό τομέα, η Ομάδα ασχολείται με την παρακολούθηση της πορείας των νεοαναδυόμενων οικονομιών της περιοχής ενδιαφέροντος του Κέντρου και την εκτίμηση της εξέλιξης τους. Τέλος, η Ομάδα είναι υπεύθυνη για την ενασχόληση με τα περιβαλλοντικά θέματα, τα οποία επισύρουν την διαρκώς αυξανόμενη προσοχή των κυβερνήσεων ανά τον κόσμο.

• Ομάδα Δημοκρατίας και Ανθρώπινων Δικαιωμάτων

Η εν λόγω ομάδα ασχολείται με τις δημοκρατικές συνιστώσες, την κοινωνία πολιτών καθώς και τις Μη Κυβερνητικές Οργανώσεις των χωρών της Ευρασίας και της Νοτιανατολικής Ευρώπης. Η Ομάδα, επίσης, ασχολείται με τις μειονότητες καθώς και με τις ευαίσθητες κοινωνικές ομάδες.

• Ομάδα Νοτιο-ανατολικής Ευρώπης

Η Ομάδα Νοτιο-ανατολικής Ευρώπης στοχεύει στη μελέτη και καταγραφή των εξελίξεων στην περιοχή των Βαλκανίων. Εκτιμά πολιτικά, οικονομικά, ενεργειακά και κοινωνικά δεδομένα και προβαίνει στην εκτίμηση της πορείας των χωρών των Βαλκανίων.